1955年属烟墩区建设乡。
1956年后属晓星乡。
1958年为晓星管理区黄港大队。
1961年晓星管理区分为大圩、晓星两个公社，慈云大队由黄港大队分出，属大圩人民公社。
1968年大圩、晓星两公社合并成立东方红人民公社，慈云大队属之。
1972年大圩、晓星两公社再次分开，慈云大队又划为大圩公社管理。
1978年划归合肥市郊区。
1983年为大圩乡慈云村。
1992年大圩、晓星两乡再次合并为大圩乡。
2007年属大圩镇至今。