1949年，新中国建立后，成立莲云行政村，村址设在东庄自然村，隶属河南乡人民政府；1955年隶属河南乡人民委员会；1956年成立灯塔高级社，隶属金涂乡；1958年10月“政社合一”，更名为灯塔生产大队，隶属金涂人民公社；1970年，灯塔生产大队分为涂山、灯塔、莲云生产大队，村址设在塘庄生产队，隶属新桥人民公社；1984年1月，实行政社分开，恢复乡（镇）建制，更名为莲云村民委员会，隶属新桥乡人民政府，村址设在花古自然村；2004年1月，因行政区划调整，隶属姑孰镇人民政府；2005年10月，村级规模调整，村址设在花古自然村至今。
2007年，村址向北迁200米莲云小学内，属花古组。