1949年4月21日，建立荻港镇。
1950年初废镇并区，成立荻港区。
1952年8月划乡建镇，荻港归属第三区管辖。
1956年撤区并乡，分设荻港镇、桃冲镇，石垅乡。
1958年9月，政社合一，成立长龙山人民公社。
1960年改长龙山人民公社为荻港人民公社。
1965年，6月社政分制，荻港街道大队改为荻港镇，与荻港人民公社同级并立。
1968年8月，荻港人民公社管理委员会改称荻港人民公社革命委员会，同年9月，荻港镇人民委员会改称荻港镇革命委员会。
1978年8月，撤销荻港镇革命委员会。
1984年3月，公社改乡镇，为荻港乡。
1984年4月，荻港镇、荻港乡合并为荻港镇。
2003年12月乡镇区划调整，荻港镇与芦南乡合并为新的荻港镇，沿用至今。