建国初期分为南坛、四明、平联行政村，属第五区；1952-1955年为伏岭区水村乡；1956年并入北村乡，属伏岭区；1958年建立水村大队，属伏岭公社北村管理区；1961年分设水村、大坞、芷白3个大队，属北村公社；1963年大坞大队改称新屋下大队，隶属不变；1983年体制改革，为北村乡水村村、新屋下村、芷白村；2001年水村村、新屋下村、芷白村随北村乡并入伏岭镇；2003年全县村级（社区）规模调整，水村村、新屋下村、芷白村合并为水村村，属伏岭镇至今。