民国时期，属河北省大兴县。
民国三十七年（1948年），先后属共产党领导的河北省平北专署昌顺联合县九区和北京市第十四区、第九区、第十三区。
1949年8月，大部划归河北省昌平县。
1956年，属北京市东郊区。
1958年5月，东郊区改名朝阳区；10月，成立和平、朝阳、幸福、红光4个人民公社。
1959年1月，孙河公社为朝阳区7公社之一，后为生产大队。
1984年，公社改乡，孙河乡为朝阳区二级乡，仍归农场系统管理。
1998年，属朝阳区和平农村办事处。
1999年，撤销和平农村办事处，建立孙河地区（乡）办事处。
2004年5月，黄港乡并入孙河乡。