大石窝地区历史悠久，明代山西迁徒民至此定居前早有人烟生息。
1949年，大石窝地区属房山县三区。
1953年，大石窝地区属房山县新五区。
1954年，大石窝地区属房山县下滩、石窝、南尚乐、北尚乐、石门5个乡。
1956年，大石窝地区属南尚乐、下滩、石窝3个乡。
1958年，大石窝地区划归周口店区长沟人民公社南尚乐管理区。
1961年，大石窝地区划归房山县南尚乐人民公社。
1983年，南尚乐公社改乡。
1986年，南尚乐乡属房山区。
1995年，南尚乐乡乡改镇。
2001年，南尚乐镇镇址迁石窝村，更名大石窝镇。