西周为燕国的都城所在地。
战国为燕国中都属地。
明代，为燕谷里。
清代，为琉璃河镇。
民国五年（1916年），琉璃河镇属良乡县第六南一区。
民国十七年（1928年），琉璃河镇属良乡县三区。
1949年，琉璃河镇属良乡县七区。
1951年，琉璃河镇属良乡县三区。
1956年，琉璃河镇属良乡县。
1958年，琉璃河镇属周口店区琉璃河人民公社。
1960年，琉璃河镇属房山县琉璃河人民公社。
1966年，设琉璃河镇。
1968年，并入琉璃河人民公社。
1980年，恢复琉璃河镇。
1983年，琉璃河公社改乡。
1989年，琉璃河撤乡设琉璃河地区办事处。
2000年，在琉璃河地区办事处设琉璃河镇（两块牌子，一套人马）。
2002年，合乡并镇，东南召镇与窑上乡并入琉璃河镇。