巴南区的前身是千年历史名邑巴县。早在3000多年前的商代，巴人就在此繁衍生息，立国建都。秦代置巴郡，南朝齐代置垫江县，北周时改称巴县并沿袭至1995年。1995年经国务院批准撤县建区，成立巴南区。历史上，巴县先后涌现出了“宁抛头颅不丢寸土”的英雄将军巴蔓子、“革命军中马前卒”邹容、辛亥革命志士杨沧白、新中国首任女大使丁雪松等优秀儿女。区境内常住人口以汉族为主，其次有苗族、回族、藏族、彝族等40多个少数民族2500余人。
巴南区位于重庆市主城区南部，属重庆都市经济发达圈。全区幅员面积1827平方公里，辖花溪镇、南泉镇、界石镇、南彭镇、惠民镇、木洞镇、双河口镇、麻柳嘴镇、丰盛镇、二圣镇、东泉镇、姜家镇、天星寺镇、接龙镇、石滩镇、石龙镇、一品镇、跳石镇、安澜镇19个镇和鱼洞、李家沱两个街道办事处。截止2006年底，全区有206个村、77个社区居委会。东与重庆市涪陵区、南川区接壤，南与綦江县、江津区毗邻，西与九龙坡区、大渡口区隔江相望，北与南岸区相接。区政府驻地鱼洞，距市政府驻地21公里，距重庆火车站22公里，距重庆港口23公里，距重庆机场45公里。
巴南区区位优势明显。距重庆市中心7公里，区政府距市政府驻地21公里。长江横贯区境，李家沱和马桑溪两座长江大桥沟通南北，重庆“二环八射”中有“二环二射”（内环、绕城，渝黔、渝湘）贯穿区境，其中，渝黔、渝湘两大出海通道与内环、绕城快速通道在境内交汇；正在建设的渝利铁路巴南段，规划中的渝黔铁路复线綦江段经一品、界石支线，以及全市规划的9条轻轨线中有3条线（2号线、3号线、8号线）进入境内
巴南区地形以丘陵为主，低山次之，平地极少。土壤类型有水稻土、紫色土、荧壤土、潮土等。属亚热带温润气候，四季分明，春早秋迟，夏热冬暖，初夏有梅雨，盛夏多伏旱，秋季有绵雨，冬季多云雾，霜雪甚少，无霜期长，日照少，风力小，湿度大。境内河流属长江水系，有流经境内的五布河、花溪河、一品河等大小河流10余条，流域面积1702.24平方公里，占区幅员面积的93.30%。区内有各种水利设施5075处，总蓄水量12040万立方米，常年灌溉面积33.42万亩，有效灌溉面积25.87万亩，农业丰收有较可靠的保证。
巴南区自然资源丰富，开发潜能大。全区有植物资源近4000种，农作物品种繁多，除栽植粮、油、蔬菜和大量经济作物品种外，经济果木有柚、柑橘、梨、枣、桃、李、杏、板栗和茶、桑、桐等。区境内有动物资源数百种，有矿资源数十种。曾先后开发利用的有原煤、铁矿、石油、天然气、页岩、石灰石、白云石、石英砂、钾土、砂金、地热水等。石灰石、白云石、石英砂和钾土、砂金等资源的开采，成为农民致富的门路之一。全区现有多家页岩砖厂，对页岩的开发利用数量较大；地热水的出水点较多，已在东泉、南泉、桥口坝等地多处开发利用。
巴南区山川秀美，旅游资源丰富。全区的森林覆盖率超过25%，山、水、林、泉、洞、湖、溪、河、瀑、谷等自然资源和抗战文化遗址、民俗文化等人文旅游资源遍布区内，形成了“三泉”（南泉、东泉、桥口坝温泉）、“三山”（圣灯山、樵坪山、云篆山）、“两岛”（木洞桃花岛、鱼洞中坝岛）、“一湖”（南湖）、“一洞”（姜家溶洞）、“一场”（重庆国际高尔夫球场）、“一区”（安澜鹭类自然保护区）的景区格局。尤其是素有“天然-浴”美誉的东温泉热洞更是亚洲一绝；“川东小峨眉”圣灯山被誉为“植物基因宝库”；樵坪山、云篆山古战场遗迹依稀可辨。2001年被评为中国“优秀旅游城区”。
【历史沿革】巴南区由巴县改设而成，从古至今名凡五易。在刘宋以前曰江洲，齐、梁、西魏曰垫江，自宇文周曰巴县，民国元年（1912年）易名重庆府，民国2年恢复巴县。1995年始为今称。
西周至战国，辖境属巴国地。周慎靓王五年（公元前316年）秦灭巴国，周赧王元年（公元前314年）秦在巴国旧域设县治理，江州县为其一，隶于巴郡。南齐永明五年（公元487年），改江州县为垫江县，北周武成三年（561年）又改垫江县为巴县，并废枳县入于巴县。
巴县新置时属楚州巴郡，隋代属渝州、巴郡，唐代属渝州、南平郡、渝州，宋代属渝州、恭州、重庆府。元代属重庆路，明清时期属重庆府；辛亥革命后由重庆蜀军政府直辖，民国2年属川东道（后改为东川道），民国17年属四川省；解放初属川东区巴县专区，旋属璧山专区，1951年1月改属重庆市，1953年2月划属四川省江津专区，1958年11月回属重庆市。1994年12月，撤县设区，为重庆市辖近郊城市区。
自周赧王元年（公元前314年）起至民国28年（1939年）间，均设县治于今重庆市渝中区解放东路，历与郡、州、路、府同城而治，并为附廓大县。此后治地多迁。民国28年，按国民政府令，县政府迁至市外办公，暂住人和乡（今九龙坡区华岩镇），民国30年迁驻新治李家沱马王坪。解放后由于市县界变动，于1952年10月暂迁南温泉，1954年1月迁驻鱼洞镇。改县设区后治地仍旧。
由县而区，古今沿革，辖境多易：
巴县新置时，幅员辽阔，辖今之渝中区、江北区、沙坪坝区、九龙坡区、大渡口区、巴南区、南岸区、渝北区、北碚区大部、璧山县、长寿县和涪陵市枳城区、李渡区、南川市、武隆县所属区域。
北周保定四年（564年），划出今涪陵市枳城区、李渡区、武隆县所属区域，置涪陵镇。
唐武德元年（618年）、武德三年（620年）、贞观四年（630年）、贞观十一年（637年）、至德二年（757年），划出今长寿县、南川市所属区域及中梁山以西大部分地区，先后分置永安、乐温、温山、南平、隆化、璧山诸县。
元至元二十二年（1285年）废壁山，其地并入。
明成化十九年（1483年），划出缙云山以西境域，复置璧山县。清乾隆二十四年（1759年），划出今江北区、渝北区所属区域及北碚区所辖嘉陵江以北地区，置江北厅，又划出祥里部分地区（宋代依来乡）隶璧山县。
民国18年（1929年）重庆建市，自民国21年市县划界起至1960年的28年间，迭经市县界变动和邻县县界调整，先后划出县境中梁山与长江、嘉陵江之间除今跳蹬镇以外的地区（含当时的重庆城区）、今歇马镇及其以北的地区、今南泉镇及沿铜锣山至峡口镇的沿江地区、高歇和马鬃两乡所属区域。其间于1953年，原属北碚市的关口乡划入巴县。
至1994年，县境东西宽73公里，南北长70公里，幅员面积2551.26平方公里，仍三面环绕重庆市区。
1994年12月，改巴县为重庆市巴南区，并在1995年2-3月间相应进行辖区调整，划出原巴县所辖长江以北的全部境域和长江以南的长生桥、迎龙、广阳3镇所属区域，划入九龙坡区所属长江南岸的地区（除二塘村划归南岸区外），遂成今之巴南区域。