清康熙四十六年（1707年），麻柳嘴镇境域属仁里七甲。
民国元年（1912年），麻柳设辖区；民国十九年（1930年），为麻柳里；民国二十年（1931年）6月，麻柳里改为麻柳乡；民国二十四年（1935年），麻柳乡改为麻柳联保；民国三十年（1941年），麻柳联保改为麻柳乡。
1952年12月，麻柳乡析置天池乡、清溪乡、平桥乡3乡。
1954年4月，平桥乡并入麻柳乡。
1955年12月，清溪乡并入麻柳乡。
1956年1月，天池乡并入麻柳乡；同年11月，恢复清溪乡。
1958年9月，清溪乡、麻柳乡合并建麻柳公社。
1959年2月，麻柳公社改为麻柳管理区。
1960年12月，麻柳管理区改为麻柳公社。
1961年6月，麻柳公社析置天池公社。
1981年8月，麻柳公社更名为麻柳嘴公社。
1982年，麻柳嘴公社改为麻柳嘴乡。
1993年12月，麻柳嘴乡、天池乡合并建麻柳嘴镇。
1995年1月，撤销巴县建立巴南区，麻柳嘴镇属之。
2001年7月，清溪乡并入麻柳嘴镇。