宋、元时期，魁斗分属归善乡长泰里和修仁乡崇善里；明、清时期，分属长泰里和崇善里；民国初期，分属县城区、兴善区、第一区；民国34年（1945年）后，分属城苑镇、溪东乡、泰安乡；中华人民共和国成立后，先后分属龙城区、清溪区、第一区、第二区、第三区、城关区；1958年11月，属城关人民公社；1961年8月，属城关区；1965年4月，撤区成立魁斗人民公社；1984年4月，改为魁斗乡；1992年8月，改为魁斗镇。