据上辈老人口述：顶坑村在明末崇祯期间，因战乱引发社会动荡而从漳浦县移居于此；1949年解放后属莆田县第八区管辖（称党坑乡），1949年解放后属8区渡里乡，1952年属15区，1954年属14区，1955年属党城乡，1957年属党渡乡顶坑村，1958年属常太公社顶坑大队，1961年属渡山公社顶坑大队，1965年属常太公社顶坑大队，1984年12月改为常太乡顶坑村委会。
1992年月10月属莆田县常太镇。
2002年为莆田市城厢区常太镇顶坑村委会。