宋朝时期属晋江县晋江乡棠阴里、爱育里;元、明、清朝时期属晋江县三十八都泉山埔;民国时期属晋江县东北乡清源保;1949年属晋江县第三区清源乡;1958年从晋江县析出,归泉州市管辖,置北峰公社清源农场、泉州共青团农庄、清源茶果社;1959年将三者合并,成立泉州市亚热带作物试验场;1960改称清源农场;1961年改为泉州市清源农场第六管区;1999年8月8日设泉州市清源街道清源村民委员会;2003年改为泉州市清源街道清源社区居民委员会。