原属海澄县三都。
清朝时，这里属集兴下半保。
民国时期，1940年，为第四区（后名海沧区）金钟乡锦里保。
1946年5月属海沧乡锦里保。
建国后废除保甲制，为第四区(海沧)锦里乡。
1958年4月撤区并乡，此地为海沧乡管辖。
1958年8月，划归厦门市，属厦门市郊区海沧公社，设锦里大队。
1961年10月从海沧公社析设锦里公社，1964年5月，复入海沧公社。
1984年改为海沧乡（1986年改镇）锦里村。
1987年7月郊区改集美区，辖之。
1995年10月海沧、东孚镇划入杏林区。
2003年10月置海沧区，辖之。
2006年1月撤销海沧镇析分为海沧街道、新阳街道，为海沧街道锦里村。