自古以来，日溪就是中原通向福州的“入省通道”和“通津要口”，古时日溪被称为“密溪”，后因福州方言中“密溪”与“溺溪”发音相同，不吉，后改为“日溪”。
目前尚有两条古驿道保存完好。
明、清属侯官县五十七都管辖，民国设闽侯县第八区日溪乡日溪村，1949年12月划归闽侯县第八区（即石牌区）日溪乡日溪村，1961年12月归福州郊区设日溪公社，日溪大队，1971年3月成立北峰区，设日溪公社、日溪大队，1984年日溪乡日溪村委会至今。