原属古田县境。
清雍正十三年（1735年）屏南建县后，属屏南县三都和五都。
1914年，属南一区。
1936年，属第一区，区公署驻棠口。
1940年，撤区设12个乡镇，设棠口镇。
1943年，全县设8个乡镇，属棠漈乡。
1949年中华人民共和国成立后，属第一区，区公所驻棠口。
1950年12月，属第三区，区公所驻棠口。
1956年7月，设棠口区，区公所驻棠口。
1958年5月，全县撤区改设4个指导小组。
1958年9月，棠口指导组更名先锋公社，1959年5月更名为棠口公社。
1961年8月，全县划10个公社，设棠口公社。
1984年9月，撤人民公社建制，成立乡人民政府，改生产大队为村民委员会，其辖区称行政村，改生产小队为村民小组。
2018年1月10日，根据福建省人民政府做出关于屏南县棠口乡撤乡设镇的批复（闽政文〔2018〕8号）文件，屏南县撤销棠口乡，设立棠口镇。