西晋太康三年(282年)从晋安县析置同安县（同安之名始此），是年复并入晋安县。
隋为南安县地。
唐贞元十九年(803年)析南安县西南四乡置大同场。
五代后唐长兴四年（即933年，一说五代后唐天成四年929年，另说后晋天福四年939年），升大同场为同安县，同安县建制始此。
治所今大同街道，属清源军节度。
宋改清源军为平海军，仍属之，为绥德乡（同禾、民安、翔风、嘉禾四里）、永丰乡（长兴、从顺、感化、归德四里）、明盛乡（仁德、安仁、积善三里）。
元属泉州路，明、清属福建省泉州府。
清乾隆四十年(1775年)，析县东境的翔风里、民安里及同禾里五、六、七都置马巷厅。
1912年马巷厅废，仍归同安县。
1913年析嘉禾里置思明县。
1913年废府州，属南路道。
1914年属厦门道，同年析翔风里浯洲（金门岛）、烈屿及大、小嶝岛置金门县。
1928年废道，直属福建省。
1934年属驻泉州的第五行政督察区。
1935年属第四行政督察区，1949年属第五专区。
1950年属泉州专区，同年9月改属晋江专区。
1953年11月，集美乡划归厦门市。
1957年西境灌口区锦宅乡、金山乡划归龙溪县（今龙海市），灌口区其余12乡划归厦门市。
1958年后至今为厦门市辖（1970—1973年曾回属晋江地区）。
1996年11月同安撤县设区。
2003年同安区析东部大嶝、马巷、新圩、新店、内厝5镇置翔安区。