吴山底，古名儒源，位于镇区西南5公里，海拔1015米。宋太平兴国二年（977年），吴仁部从灵鹫院（今龙住院）迁入拓居，其伯父及兄仁隆亦从浙江省庆源县举溪村相继迁入。端拱二年（989年）年10月，吴仁部迁南源（今狮城南庄）定居，将田地捐献玉山禅寺，为该寺开山和尚。明正德十一年（1516年），连保五从硋窑村迁入定居。
吴山底村，原隶宁德县青田乡东洋里十七都。民国24年（1935）6月，隶周墩特种区联保。民国29年1月，隶周墩镇吴溪保。民国34年8月，隶周宁县狮城镇云山保。民国37年9月，隶紫云保。1950年4月，隶周宁县第一区（端源区）溪坪乡。1955年9月，隶紫云乡。1958年9月，隶紫云公社。1963年3月，隶浦源区紫云乡。1966年，隶浦源公社设紫云大队。1980年3月24日，从紫云大队析出设吴山底大队。1984年8月，隶浦源乡设吴山底村民委员会。1995年，全村99户、496仁，设村民小组5个。
清光绪年间，吴山底村仅有8座民房。民国时期，村民生活贫困，解放后，食、衣、住、行逐年改善。1966年9月3日，遭第十一号台风袭击，暴雨成灾，后门山滑坡，冲埋连恩年、连茂玉、郑辉长等3座民房，7人遇难。县长王清毅亲临抢险救灾，挖掘擦洗尸体，拨款安装收埋。1973年，由县地方国营钨钼矿负责修通中洲溪至吴山底简易公路3.5公里，村民置手扶拖拉机3部，三轮客运摩托车6部，改善了运输条件。1974年，县人民政府拨款9000元，资助24户新建3排排列整齐的石混结构住宅，全村住房总面积8704平方米，人均17.5平方米。1980年，建成石混结构校舍1座，单层建筑面积200平方米，5个班级，在校学生72人。1983年，完成高压输电线路架设，实现“点灯不用油”、碾米加工自动化。1989年12月~1991年1月，建成县属吴山底水库，库容量148万立方米，拦河坝高991.5米，输水渠道全长3.3公里，灌溉农田1500亩，铺设引水管供浦源村民生活用水，水库饲养大批草鱼、鲢鱼、鲫鱼。改革开放后，全村有15户在外地兴办工厂、经营商业，发家致富。1990年，每户付款40元购买镀锌管，引用石杯山泉水，流程1公里，供村民饮用。1995年，全村粮食总产1436吨，经济总收入115.7万元，人均收入2260元，村内有地面卫星接收站1个，电视机69台，占总户数的66%。