明代（1368-1644年）从1372-1644年设甘肃镇陕西行都司、甘州府。
甘州府下设左、中、右、前、后五卫管辖甘州所属区域。
五个墩隶属中卫所辖。
清代（1644-1725）继承明沿制。
仍设甘肃镇、陕西行都司，甘州五卫。
甘州为镇，行都司治所。
五个墩仍隶中卫所治。
清顺治七年（1650年）撤销甘州前卫、后卫。
民国25年（1936年）张掖县属甘肃省第六行政督察区，区置武威，五个墩村隶属不变。
民国26年（1937年）五个墩村设联保乡公所1941年撤销民国34年（1945年）属张掖县新丰乡管辖1956年筹建张掖市（地级）、张掖同时存在。
1957年市建置撤销张掖县属张掖专区，张掖县设25个乡，五个墩属沙井乡2002年10月撤销张掖专区，成立张掖市2004年沙井乡改为沙井镇五个墩村属沙井镇管辖。