民国二年（1913年），元龙隶属“东部二区”。
民国三十二年（1943年），设三岔区，辖元龙镇。
1949年8月后，设元龙等6区。
1951年5月，改为乡，其中第四区（元龙区），驻元龙镇，辖元土乡。
1952年10月，第四区（元龙区）增设玄头乡（后改名关营乡）。
1954年3月，第四区（元龙区）所属关营、陇东2乡划清水和秦安县，又从秦安县划入谢坪乡和扁坡乡。
1955年11月，元龙隶属三岔区（驻吴碧镇）。
1956年，元龙为乡。
1958年，撤乡并入葡萄公社。
1962年，为元龙区。
1968年10月，撤销区级建置，元龙公社为其中之一；后改称卫东公社。
1971年，恢复原名，称元龙公社。
1983年，改为乡。
2003年5月，元龙撤乡建镇。