1934年保甲制时，李店为上邽镇43保中的第33保(糜李村）；1950年至1955年李店村为红土乡；1956年至1957年李店村为红富乡；1958年为城关镇跃进人民公社；1961年12月，从城关镇人民公社划出红堡人民公社后，为李店大队。
1983年为红堡乡李店村民委员会；2004年1月为红堡镇李店村民委员会。
2004年12月，北坡村撤销，并入李店村。
2007年李店从山上易地搬迁在山下居住。
民国时期为保甲制，1949年初为李店村人民代表大会，1955年至1958年为李店农业合作社，1958年至1980年为李店生产大队，1983年至今为李店村村民委员会。