1949年前属西南乡第4保;1949年10月建政时属西南区(1区)中深乡(3乡)1、2、3行政村;1953年10月随乡划归新立的城郊区(12区):1955年11月撤区并乡时随乡并入香庄乡，建“香庄乡中深沟高级农业合作社”;1958年9月为“西峰公社中深沟大队”:1966年11月改称“红旗公社红旗大队”，1971年2月恢复旧名，时辖8个生产队;1983年3月改称“中深沟村”，时辖8个村民小组;2006年3月1、2、6、7、8组划入新城街道办事处管理;2017年，剩余3个村民小组划人新城街道办事处、保留城中村建置至今。