西汉前，为氐羌少数民族居住区域。
西汉时期，开发西南夷后，归益州刺史部广汉郡阴平道管辖。
明朝，归陕西行都司文县临里东路管辖。
清初，归陕西右布政使司文县管辖，名碧峪乡；康熙八年（1669年），陕甘分治，境域始归甘肃省阶州管辖。
民国元年（1912年）后，归渭川道管辖。
民国二十二年（1933年），丁德隆独立旅驻防碧口时，碧口首设区公所。
1958年4月，归天水地区专员公署管辖。
1962年12月，天水、武都分治，境域归武都地区文县管辖。
1958年4月，改为碧口公社。
1983年11月，碧口公社改为碧口镇。