1949年文县解放，1951年全县调整为6区46乡，属碧口区肖家乡辖。
1955年10月合并区、乡机构后，仍属碧口区肖家乡辖。
1958年12月成立碧口公社，为碧口公社磨河坝大队。
1961年公社划小，为肖家公社磨河坝大队。
1983年10月肖家公社改为肖家乡，为肖家乡磨河坝大队。
1984年改为肖家乡磨河坝村，村下建合作社。
1986年设立磨河坝村村民委员会，所属合作社改称村民小组。
2004年撤销肖家乡后划归碧口镇辖。