1949年文县解放，1951年全县调整为6区46乡，属石坊区石鸡坝乡辖。
1953年6月全县调整为9区70乡，杨楞干村与水磨沟村合并为水磨沟村，属中寨区陶家湾乡辖。
1956年陶家湾乡与安昌河乡合并为石鸡坝乡，今水磨沟村属之。
1958年4月石鸡坝乡并入哈南乡，今水磨沟村随之并入；12月成立石坊公社，为石坊公社水磨沟大队。
1961年公社划小，为石鸡坝公社水磨沟大队。
1983年10月石鸡坝公社改为石鸡坝乡，属石鸡坝乡辖。
1984年4月水磨沟大队改为水磨沟村，村下建合作社。
1986年设立水磨沟村民委员会，所属合作社改称村民小组。
2016年1月石鸡坝乡改为石鸡坝镇，属石鸡坝镇辖。