1950年昌马公社成立后，村级为生产大队，因上游村南面、北面、西面均被戈壁包围，因此最初取名为戈壁大队，1958年改名为上游大队，1982年12月4日在第五届全国人民代表大会第五次会议通过的《中华人民共和国宪法》有关条款中规定公社改建为乡，生产大队改建为村，同时，在村级建立了村民自治组织村委会，在村委会下设了村民小组，取代了之前的生产队，2004年合村并组时又将原来的西湖村和原上游村合并而成了现在的上游村，同时成立了上游村村民委员会。