民国元年（1912年）后，为静宁县焦韩乡。
民国三十一年（1942年），划归庄浪县，改名新陇乡。
1949年后，设新陇区。
1957年，华亭县山寨区的店峡乡、主山乡划入。
1958年9月，公社化时，设韩店公社，驻韩家店；同年12月，庄浪县并入静宁县后，属静宁县韩店公社。
1961年6月，分设郑河公社；同年12月，恢复庄浪行政区时，为庄浪县韩店公社。
1962年，又分出试雨公社。
1964年，试雨公社并回。
1983年，改为韩店乡。
2002年10月，撤乡建韩店镇。
2004年，撤销颉崖乡，将其所辖聂子坪、菜子湾两村划归韩店镇。