南宋末年麦氏先祖随文天祥抗元来广东地区，战后在当地安家落户。
清朝时期村民由广东南雄迁此定居，后从合水村分离出马山头村、薯田埔村、根竹园村。
该村先祖为麦氏九世祖南溪公后裔。
1952年10月，宝安县划分7区71乡，马山头属第七区公明乡管辖。
1963年2月，撤区并社，马山头与茨田埔合并为公明公社马田大队。
1981年1月，马山头由公明公社马田大队划分出来成为马山头大队。
1993年1月，原深圳市宝安县公明镇马山头村改为深圳市宝安区公明镇马山头村。
2004年7月，因城市化改制，更名为马山头社区居委会，名称沿用至今，隶属马田街道。