据《陈氏宗亲族谱》记载，陈忠之三子陈昂于宋徽宗十五年从广东东莞七都迁来此地定居建村。
1951年从原水贝村分出命名为上村，属宝安县四区（上南区）管理。
1952年10月，宝安县划分7区71乡，上村属第七区水蓢乡管辖。
1963年2月，公明公社合并大队，上村属公明公社上村大队。
1993年1月，原深圳市宝安县公明镇上村改为深圳市宝安区公明镇上村。
2004年7月，因城市化改制，改上村村委会为上村社区居委会，名称沿用至今，隶属公明街道。