村落创于明崇祯年间。
前属饶平县隆眼城都。
1949年属澄海县隆都区。
1953年石头坑、龙潭、西洋、下南溪合称西洋乡，属第四区。
1956年属南溪乡。
1958年9月成立澄海县人民公社，属第二支队208团。
1959年属隆都人民公社。
1984年1月设区建乡，石头坑、龙潭、西洋、下南溪合设下西乡，属隆都区。
1986年11月撤区置镇，独立设石头坑村，属东里镇。
1990年9月设石头坑管理区。
1998年9月设石头坑村，沿用至今。