莲华镇境域，由原来的十五乡沿革而来。
晋朝时期，该地归海阳县管辖。
自北宋时期开始，先后有移民在此相继创乡，形成十五个自然村。
清咸丰二年（1852年），十五个自然村结成“会乡”，因而得名“十五乡”。
1949年起，划归澄海县，为隆都区所辖。
1951年，十五乡划属澄海县苏北区。
1954年，十五乡的各自然村合并为五大乡（隆溪、碧东梅、隆北、上中、隆西乡）。
1955年，五大乡再合并为两个大乡（上隆、下隆乡）。
1956年，农村实行合作化，各自然乡先后建为初级社和高级社。
1957年，合并成立十五乡人民政府，后与东里、盐鸿两乡合并为苏北乡人民政府。
1958年，苏北乡人民政府改建为苏北公社，十五乡归属其管理。
1961年，十五乡从苏北公社划出成立十五乡公社。
1983年1月，十五乡公社改建为十五乡区人民公所。
1986年，十五乡公社改建为十五乡镇。
1995年，十五乡镇人民政府改称为莲华镇人民政府。