前属海阳县苏湾都。
明成化十三年（1477）属饶平县。
明嘉靖四十二年（1563）属澄海县苏湾都。
1921年废都设区，设南砂乡，属东陇区。
1946年南砂、南畔洲、明德里、仙市合称为南砂乡。
1949年属苏北区。
1950年6月南砂、明德、南畔洲、大围、石丁合称新联乡，属苏北区。
1951年11月撤新联乡，恢复南砂乡，属溪南区。
1953年属三区。
1957年属溪南乡。
1958年成立澄海县人民公社，南砂乡为第一支队116团。
1959年设南砂生产大队，属溪南人民公社。
1961年南砂生产大队析为东社、南社、西社、北社4个生产大队。
1984年1月设区建乡，设南社乡，属溪南区。
1986年11月撤区置镇，设南社居委会，属溪南镇。
1990年设南社管理区。
1998年9月改设南社村，沿用至今。