据史书记载，从化自秦以来隶属番禺。
明弘治二年（1489），从番禺划地设置从化县，隶属广州府。
新中国成立后，隶属省北江临时行政委员会。
1953年3月，划归粤北行政区（后称韶关专员公署）。
1958年10月，从化、佛冈两县合并为从化县，仍属韶关专员公署。
1959年1月，改属佛山专员公署。
1960年9月，改属广州市。
1961年4月，从化、佛冈重新分为两个县，各辖原有地域，从化县仍属广州市。
1994年3月，撤县设市（县级）。
2014年，撤市设区，自命名后沿用至今。