明嘉靖三年（1524年），岐石属惠来县。
民国二十五年（1937年），属隆江区鏊梅乡。
1949年7月，属隆江区。
1951年12月，归第五区管辖。
1958年9月，撤销乡镇建制，设立五个公社，岐石乡属红光公社。
1958年12月14日，撤销惠来县建制，红光公社划归普宁县。
1961年3月，恢复惠来县建制，设置岐石公社。
1983年11月9日，设区建乡，岐石为区。
1986年11月8日，设岐石区改镇。
2003年5月15日，原南海乡管辖的朱埔、和双、双湖行政村划归岐石镇管辖。