据传该地在宋朝已被起名儒村，后改名红旗村；宋朝高宗皇帝赵祯，帝号“皇佑”，于皇佑六年（公元1049）经过本村，于是村民将村名改称皇佑村；到1921年属石磜乡称皇佑村；1950年称皇佑村属北磜乡；1952年称皇佑乡；1959年属梅东公社称皇佑生产大队，1960年梅东公社改称松源公社，1961年属北磜公社；1983年属北磜区称皇佑乡，1987年属北磜乡称皇佑村委会；1990年改为皇佑管理区；1999年至今称为皇佑村民委员会；2004年撤北磜镇并入南磜镇。