1951年成立新旗乡农民协会；1953年撤销农民协会，设立新旗乡人民政府。
1960年撤销乡人民政府，设立新旗大队，隶属乐平公社管辖；1984年撤销大队，设立新旗乡人民政府。
1987年撤销乡人民政府，成立新旗村民委员会，隶属乐平镇管辖；1989年撤销新旗村民委员会，设立新旗管理区办事处，隶属乐平镇管辖，所辖村不变；1997年撤销新旗管理区，设立新旗村民委员会隶属乐平镇管辖。
自成立以来，地名一直沿用至今。