清乾隆年间，村民围海造田，后来形成居民点，合成片村，取名百顷村。
清道光年间，联成百顷大围。
民国时期属第四区，称百顷乡。
1951年改属第九区，称百顷乡。
1955年属睦洲区，称百顷乡。
1957年属百大乡。
1959年为百顷管理区上百顷一大队。
1961年属大鳌人民公社，称百顷一大队。
1965年称百顷大队。
1968年分出新一村，称红星大队。
1982年复称百顷大队。
1984年称百顷乡。
1987年称百顷村民委员会。
1988年改称百顷管理区。
1999年改称百顷村民委员会，沿用至今。