清咸丰年间（1851-1861），会城关姓族人在此雇人开田耕种，取名“关家墩”。
随后商铺增多，遂成市集。
清道光县志地图已见海中沙洲“南镇沙”。
民国时期属第八区睦洲乡，曾与黄布、腰股合为“黄腰南”。
1951年与石板沙组成第九区石南乡。
1958年属石南管理区。
1959年称南镇大队。
1961年分设南广沙大队、南镇大队。
1965年合称南镇大队。
1984年称南镇乡。
1986年为南镇村委会。
1988年改称南镇管理区。
1999年改称南镇村委会，沿用至今。