相传明成化年间（1465-1487），此地在汪洋大海中渐成小岛屿。
明末时烽烟四起，民不聊生，不少难民先后逃到此处定居。
清康熙县志《疆域图》可见“深䉪”，为县城南边的海中沙洲。
清乾隆县志记隶属于附城“宣化坊”。
民国时期至1949年前属第一区深环乡。
1951年设深吕乡。
1957年一度与九子沙合称礼南乡。
1958年称深吕管理区。
1959年底改称深吕大队。
1967年改称前进大队。
1973年复称深吕大队。
1984年称深吕乡。
1986年称深吕村委会。
1988年改称深吕管理区。
1999年改称深吕村委会，沿用至今。