明代设封门巡检司。
民国初称通门乡。
后与西宁乡合并，称永安乡。
民国时期，郁南建县前该镇地方为瑶、壮族人出没之区。
“大征”之后，于此地设千户守御所，分置营汛戌守，属地僻人稀山区，原称封门。
因为人们觉得“封门”有因为犯法而被官府封门之意不吉祥，于是根据“封”和“通”读音相近而意思刚好相反，而改称“通门”。
建国初名通门行政村，属第三区管辖。
1953年，称通门乡。
1958年，属东方红人民公社的一个管理区。
1961年，从东方红人民公社分出，成立通门人民公社，确定今辖区。
1983年，称通门区。
1987年，称通门镇，该镇是革命老区。