明朝时属下武安乡劳岳都。
清嘉庆以后，称檀圩练。
民国十六年（1927年），设为檀圩乡，属第1区。
民国三十年，灵山县共设立4个区，檀圩属第2区。
1949年12月，灵山县再次划区，檀圩属第1区。
1951年6月，设立檀圩镇，属第4区。
1955年6月，县辖第4区改称檀圩区。
1957年9月，撤区并乡，设立檀圩乡。
1958年9月，成立红旗（檀圩）人民公社；同年10月，那隆、三隆并入，驻地仍在檀圩街。
1961年6月，灵山县调整区划后设立檀圩区。
1963年撤区并社，设立檀圩人民公社。
1984年9月，撤销人民公社，成立檀圩镇。