明朝曾为思恩土知州、府、军民府治，治所在今乔利街附近。
明正德七年（1512）设凤化县，治乔利街，为今境有三级建制之始，明嘉靖七年（1528）撤凤化县，另设那马、定罗、兴隆、白山、古零5土司。
清同治九年（1870）那马土司改置那马厅。
1912年那马厅改那马县。
1915年定罗土司归那马县、兴隆、白山、古零3土司合设隆山县。
1951年7月那马、隆山2县合设马山县。
上属关系多次变更，2003年1月由南宁地区改属南宁市。