东晋大兴元年（318）分鬰林郡设晋兴郡，置郡治晋兴县（今南宁），为南宁建制之始。
南朝梁，属桂州。
隋开皇十四年（594）废晋兴郡，留晋兴县，属尹州；开皇十八年（598）晋兴县改称宣化县；大业二年（606）改属鬰州，大业三年（607）属鬰林郡（治今贵港市）。
唐武德四年（621）置南晋州，治宣化县，属岭南道；贞观六年（632），因州城西南临邕溪水，唐太宗改南晋州为邕州，“邕城”别称及“邕”简称源于此；天宝元年（742）改为朗宁郡，乾元元年（758）复名邕州；咸通三年（862）分岭南为东西两道，岭南西道治邕州，为省级政权驻地之始。
后岭南西道改为建武军。
五代天福七年（942）因避朝讳改称诚州，属楚。
后周广顺元年（951）复名邕州，属南汉，仍为建武军节度使驻地。
宋开宝五年（972）晋兴县改称乐昌县，邕州属广南西路，景祐二年（1035），乐昌县废省入武缘县。
元至元十三年（1276）改置邕州安抚司，属广南西道宣抚司；至元十六年（1279）改邕州安抚司为邕州路；泰定元年（1324）因南疆兵乱平定，元朝庭取南疆安宁义改邕州路为南宁路，属湖广行中书省，为现名之始。
明洪武元年（1368）废路置府，南宁府治宣化县，属广西布政使司。
清属广西行省。
1912年废宣化县，南宁府直属广西军政府，同年军政府改称省政府，南宁为省会；1913年6月废府置邕南道，治南宁县，属广西省；1914年6月避云南省南宁县（今曲靖市）同名改称邕宁县，邕南道改称南宁道；1927年废南宁道，直属广西省；1929年7月设南宁市政府，与邕宁县合署，同年11月撤销市政府；1930年置邕宁民团区，驻邕宁县，属广西省；1932年4月，邕宁、宾阳2个民团区合并置南宁民团区，治武鸣，属广西省；1934年改置南宁行政监督区；1936年广西省会迁至桂林；1939年南宁行政监督区治所改驻南宁；1940年南宁行政监督区改为第九行政督察区，属广西省；1942年和第八区合并为第四行政督察区，治南宁；1949年12月4日南宁解放；1950年2月建置南宁市，为广西省会；1952年12月广西省设桂西僮族自治区，为区政府驻地；1956年为桂西僮族自治州政府驻地；1958年3月5日广西僮族自治区成立，为首府；1959年南宁市改由南宁专区代管；1961年12月复为广西僮族自治区直辖；1965年属广西壮族自治区至今。