南朝，在梁县境内置永业郡（现岑溪市大部分地区），农业经济有所发展，集市贸易初步形成。
宋朝至清末，逐渐形成一些规模小，以农产品交易为主的圩市。
明洪武十年（1337年），全岑溪全县编户三里，分为七个乡：上化乡、下化乡（今岑城镇、樟木乡、马路镇一带）为一里；归义乡、永业乡（今归义镇、大业镇、筋竹镇、诚谏镇一带）为一里；连城乡、西乡、南乡（今水汶镇、大隆镇、梨木镇、南渡镇、县容镇一带）为一里。
清乾隆《岑溪县志》记载，时岑溪县有长宁圩（即樟木旧圩）、水汶圩、南仪圩、西安圩（在昙容村北）四圩。
民国初年，推行自治，改乡为区，岑溪全县划分为9个区，水汶为连城区（原第四、五区）管辖。
（连城乡上里为第四区，连城乡中、下里为第五区）。
清代，属岑溪县。
民国二十二年（1933年），设有水汶乡，属岑溪县连城区。
1950年，设水汶区。
1958年9月，设大跃进公社。
次年7月，大跃进公社改为水汶公社。
1961年5月，水汶公社改为水汶区。
1968年，水汶区改为水汶公社。
1984年10月，水汶公社撤改为水汶乡。
1989年8月，水汶乡改为水汶镇。