民国时期，实行新宪制，改区、联保为乡（镇），隶属册阳镇；1958年，建立红旗生产大队，成立红旗生产大队管理委员会，隶属册阳区者楼公社；1984年，册亨县行政区划变动，红旗生产大队管理委员会更名为红旗村民委员会，隶属城关镇；1991年，实行建镇并乡撤区，城关镇、高洛乡和册阳乡合并为者楼镇；1998年，红旗村委会隶属者楼镇；2007年，实行村级整合，红旗村委会隶属者楼镇；2016年，行政区划调整，者楼镇划分为者楼街道和纳福街道，红旗村委会隶属纳福街道。