解放前，南门村隶属遵义县洗马镇石字保。
解放初期未建南门村，隶属遵义县丰乐镇颜村乡兰家村，1950年9月至1952年7月，兰家村划归遵义市管辖，南门隶属兰家村。
1952年7月建遵义市南关乡政府，至1955年8月，南门隶属兰家村。
1955年8月至1958年8月建立幸福庄高级社，南门隶属幸福人民公社管理委员会，兰家村改为兰村大队，南门归兰村大队管辖。
1959年3月至1961年9月，幸福庄公社与丰乐公社合并为“遵义市丰乐公社”，公社下设南关管理区时南门师专农场实行“以厂带社”，1960年回归原建置，南门仍属南关管理区兰村大队。
1961年8月，政区调整，南门大队建立。
至1984年4月，人民公社管理委员会改称乡人民政府，南门大队改称南关乡南门村。
1993年4月，乡改称镇，南门村改称南关镇南门村委会。
2016年6月，撤南关镇设南关街道办事处。