双井镇原名新城，新城古为凉伞屯。
明崇祯四年（1631年），始称新城。
民国二十一年（1932年），设双井镇。
1949年11月，施秉县接管除施秉六合乡以外的全部地区，各乡均划为区，新城、翁西、白岩、塘珠4乡为双井区。
1953年4月，县内改建，属第一区公所，称新城乡。
1956年11月，塘珠乡并入新城乡，白岩乡并入翁西乡。
1969年2月，撤销区级设置后，双井、翁西合并为东风公社。
1984年3月，撤销公社设置，建立区人民政府，原东风公社拆分为翁西乡和双井区。
1992年，撤区并镇，翁西乡、双井区合并为双井镇。