2010年得名沿用至今。
1953年属中心乡，1956年本庄乡，建新寨、柿坪高级社，1958年建云屯大队，1985年更名云屯行政村。
2010年更为云屯村委会。
民国32年（1943年），石阡实行新县制，废除之前的的区级组织，设置乡镇保甲。
设立庄乐甲级乡。
1950年2月行政区划调整，设立三个区18乡镇。
隶属三区。
1950年7月，改置3区为6区1镇。
隶属六区。
1953年，设立本庄区本庄乡。
1958年，本庄乡改称本庄公社；云屯村改称云屯大队。
1984年，本庄公社改称本庄镇；云屯大队改称云屯村。
期间隶属本庄区本庄镇（公社）。
1992年“撤并建”，由本庄区的白龙乡、本庄镇、乐桥乡、狮柳乡合并，设置本庄镇。
2003年全县推进“撤小村并大村”工作，云屯村并入山口坳村。
2010年，经石阡县人民政府石府复[2010]63号批准，全镇再次对行政村进行调整，恢复云屯村。
2010年至今隶属本庄镇。