汉代，属营县。
唐代，属带水县。
唐末至明后期，属播州。
明万历二十九年（1601年），设遵义县，镇境属通平里、乐安里。
清宣统三年（1911年），分属东二区和东三区。
民国三十年（1941年），属虾子区。
1958年，虾子、新舟2区合并为虾子基层公社。
1992年，原虾子镇及宝合、乐安、南坪、兰生4村建新的虾子镇。
1994年10月，青山片区由喇叭镇划入。
2013年7月，遵义县（今播州区）虾子、三渡、永乐三镇划新蒲新区托管。
2016年4月5日，贵州省政府办公厅公布国务院对贵州省人民政府《关于调整遵义市部分行政区划的请示》（黔府呈〔2015〕31号）作出批复，同意将原遵义县的新舟镇、虾子镇、三渡镇、永乐镇、喇叭镇和遵义市汇川区的北京路街道划归遵义市红花岗区管辖。
2016年—2019年，虾子镇不变，由新蒲新区托管。