清康熙二十二年（1683），清政府在黑龙江左岸旧瑷珲设置黑龙江将军衙门，1685年，黑龙江将军所迁至江右岸瑷珲。
1913年，建立瑷珲县。
1946年4月1日，恢复了黑河地区行政办事处。
7月24，爱辉县政府归并于黑河地区行政办事处。
9月16日，撤消黑河行政办事处，成立了黑河行政区督察专员公署。
1956年，以瑷珲二字生僻难认，改为爱辉县。
1980年底，黑河镇、幸福公社、西岗子煤矿、东方红煤矿从爱辉县分出，建立黑河市。
1983年6月，爱辉县并入黑河市。
1993年3月，原黑河地区行署改建制为黑河市（地级），原黑河市（县级）改建制为爱辉区，成为新黑河市唯一的市辖区，原行政区划不变，史称两撤两建。
名称沿用至今。