原属依兰县三道通区管辖。
1947年1月，划归刁翎县，隶属三道通区。
1948年3月增设莲花区。
1949年1月撤销刁翎县，划归林口县管辖，撤销莲花区并入三道通区。
1956年撤区划乡，设字砬子乡，1957年并入三道通乡。
1958年三道通乡改称奋斗人民公社。
1961年从奋斗公社划出部分生产大队组建新公社，因莲花村附近有个天然“莲花泡”，故命名莲花人民公社。
1984年改为莲花乡。
1997年5月，改设莲花镇。
2004年7月30日，镇驻地由字砬子村迁址莲花村。
名称沿用至今。